El hospital comenzó a funcionar el 4 de junio de 1947 cuando Salud Pública recibió en forma de donación de Parques Nacionales, el edificio que once días más tarde sería inaugurado como Hospital Regional. Sus primeros directores fueron el Dr. Pérez y el Dr. Rebori, en tanto que el plantel médico lo integraron la Dra. Marta Teodora Schwarz y el Dr. Rodolfo Alvarado.
El nosocomio contaba con los siguientes recursos: dos administrativos, siete sub-técnicos y nueve personas de maestranza y servicios. Por aquellos días el hospital disponía de dos consultorios externos y un sector de internación en donde se efectuaban cirugías de mayor y menor complejidad.
Con el paso del tiempo, en septiembre de 1969, y al incorporar más servicios de salud comenzó a funcionar como SAMIC bajo la dirección técnica del Doctor Enrique E. Schmidt. Otro cambio organizacional llegó en enero de 1995 cuando pasó a ser Hospital Público de Autogestión
Actualmente la ampliación, refuncionalización y la creación de nuevos servicios en el Hospital Marta Schwarz de Iguazú viene a constituir un rasgo distintivo para la salud de la Zona Norte de la Provincia.
Es emblemático el mejoramiento de su infraestructura e incorporación de nuevos servicios, no solo par los pobladores de la zona sino también para el turismo nacional e internacional que habitualmente concurren a este destino turístico por excelencia en el país.
Actualmente su director es el Doctor Mauricio Reartes
